蛋白质电荷计算器
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蛋白质电荷计算器根据带电氨基酸的存在,帮助确定pH 7时蛋白质序列的净电荷。了解蛋白质电荷对于预测其在生化环境中的溶解度、稳定性和相互作用至关重要。
计算器的工作原理
- 考虑的氨基酸:在pH 7时具有显著电荷的主要氨基酸是天冬氨酸 (D)、谷氨酸 (E)、赖氨酸 (K)、精氨酸 (R) 和组氨酸 (H)。
- 电荷值:使用的近似电荷为:
- D, E: -1
- K, R: +1
- H: +0.1 (由于侧链pKa导致的部分电荷)
计算示例
对于像“DEKRH”这样的序列,净电荷为: \[ \text{净电荷} = (-1) + (-1) + (+1) + (+1) + (+0.1) = +0.1 \]
应用和重要性
计算蛋白质电荷在蛋白质纯化、制剂和结构生物学中非常重要,因为电荷会影响蛋白质在不同条件下的行为。