蛋白质流体力学半径计算器

蛋白质的流体力学半径(Rh)是生物物理研究和蛋白质分析中一个关键参数。它提供了蛋白质在溶液中大小和形状的 insights，这对于理解蛋白质的行为和相互作用至关重要。

计算公式

估算纳米(nm)为单位的流体力学半径(Rh)的经验公式为：

\[ Rh (nm) = 0.066 \times MW^{1/3} \times k \]

• MW 是以千道尔顿 (kDa) 为单位的分子量。
• k 是形状因子，其值介于 0.2（对于高度紧凑的结构）和 1.0（对于高度拉长的结构）之间。

示例计算

对于分子量为 50 kDa 且形状因子为 0.6 的蛋白质：

\[ Rh = 0.066 \times (50)^{1/3} \times 0.6 \approx 1.12 \text{ nm} \]

重要性和应用场景

流体力学半径对于表征结构生物学、生物物理学和药物开发等各个研究领域的蛋白质至关重要。此计算器为科学家提供了一种根据蛋白质的分子量和结构形状估算蛋白质大小的简便方法。

常问问题

1. 什么是流体力学半径？

   • 流体力学半径是蛋白质在溶液中移动时的有效大小，它考虑了蛋白质的形状和水合作用。

2. 为什么形状因子很重要？

   • 形状因子校正了偏离球形形状的蛋白质的半径，更准确地反映了它们真实的尺寸。

3. 分子量如何影响 Rh？

   • 更大的分子量通常对应于更大的半径，但这种关系是非线性的，并且取决于蛋白质的形状。